Lieferung und Installation Sequenzierer für die Genomsequenzierung

Lieferung und Installation von Sequenzierern für die NGS-Einheit der Universitätsmedizin Rostock, inkl. Zubehör und Wartungsservice für 48 Monate. Lieferung und Installation von Sequenzierern für die NGS-Einheit der Universitätsmedizin Rostock, inkl. Zubehör und Wartungsservice für 48 Monate.

CPV: 38000000 Laborgeräte, optische Geräte und Präzisionsgeräte (außer Gläser)
Ausführungsort:
Lieferung und Installation Sequenzierer für die Genomsequenzierung
Vergabestelle:
Universitätsmedizin Rostock
Vergabenummer:

1. Beschaffer

1.1 Beschaffer

Offizielle Bezeichnung : Universitätsmedizin Rostock

2. Verfahren

2.1 Verfahren

Titel : Lieferung und Installation Sequenzierer für die Genomsequenzierung
Beschreibung : Lieferung und Installation von Sequenzierern für die NGS-Einheit der Universitätsmedizin Rostock, inkl. Zubehör und Wartungsservice für 48 Monate.
Kennung des Verfahrens : be53c070-381c-477e-88c1-ed7c60ecd9a2
Verfahrensart : Verhandlungsverfahren ohne Aufruf zum Wettbewerb

2.1.1 Zweck

Art des Auftrags : Lieferungen
Haupteinstufung ( cpv ): 38000000 Laborgeräte, optische Geräte und Präzisionsgeräte (außer Gläser)

2.1.2 Erfüllungsort

Ort im betreffenden Land

2.1.4 Allgemeine Informationen

Rechtsgrundlage :
Richtlinie 2014/24/EU

5. Los

5.1 Technische ID des Loses : LOT-0001

Titel : Lieferung und Installation Sequenzierer für die Genomsequenzierung
Beschreibung : Lieferung und Installation von Sequenzierern für die NGS-Einheit der Universitätsmedizin Rostock, inkl. Zubehör und Wartungsservice für 48 Monate.

5.1.1 Zweck

Art des Auftrags : Lieferungen
Haupteinstufung ( cpv ): 38000000 Laborgeräte, optische Geräte und Präzisionsgeräte (außer Gläser)

5.1.2 Erfüllungsort

Ort im betreffenden Land
Zusätzliche Informationen :

5.1.6 Allgemeine Informationen

Auftragsvergabeprojekt ganz oder teilweise aus EU-Mitteln finanziert
Die Beschaffung fällt unter das Übereinkommen über das öffentliche Beschaffungswesen : ja

5.1.16 Weitere Informationen, Schlichtung und Nachprüfung

Überprüfungsstelle : Vergabekammern beim Ministerium für Wirtschaft, Infrastruktur, Tourismus und Arbeit Mecklenburg-Vorpommern

6. Ergebnisse

Direktvergabe :
Begründung der Direktvergabe : Der Auftrag kann nur von einem bestimmten Wirtschaftsteilnehmer ausgeführt werden, da aus technischen Gründen kein Wettbewerb vorhanden ist
Sonstige Begründung : Im Rahmen der UMR-Initiative zur Ertüchtigung zur perspektivischen Teilnahme an genomDE sieht die UMR zum Ausbau der Sequenzierkapazitäten die Anschaffung von Sequenziergeräten vor. Im Rahmen der Ausstattung soll das NovaSeq X Sequencing System zzgl. des DRAGEN Servers (Secondary analysis) von Illumina angeschafft werden. Das NovaSeq X System ermöglicht eine einzigartige Kombination aus Skalierbarkeit des Durchsatzes, Laufflexibilität und z.T. integrierter Informatik. Diese Funktionen erlauben es den Anwendern des Systems NGS Projekte sowohl schnell als auch kostengünstig durchzuführen. Die Kapazität erlaubt Exom-/Genom Sequenzierung und gleichzeitige Möglichkeit des tiefen Sequenzierens für onkologische Fragestellungen der Pathologie und der Hämatologie/Onkologie. Das System weist folgende exklusive Hauptmerkmale auf: ■ Lyophilisierte Reagenzien ermöglichen den Versand der Reagenzien (Kits) bei Umgebungstemperatur und verringern die Verpackungsgröße. Dies schont Lagerflächen und reduziert Abfallmengen. ■ Patentierte Technologie SBS (Short Read) für DNA jeglicher Herkunft (FFPE, Blut, Speichel). Fluoreszenzmarkierte Nukleotidtechnologie ■ NovaSeq X hat zudem eine Kombination an Merkmalen, die andere Anbieter nicht anbieten und ist daher unumgänglich für die geplanten Anwendungen. Insbesondere stellt die Kombination an Daten-Output und Datenqualität ein erforderliches Alleinstellungsmerkmal dar: Datenqualität: (Anforderungen für Proben Hämatologie/Onkologie und Pathologie, (FFPE Material)): - 2 * 50 bp > 90% of bases higher than Q30 - 2 x 100 bp > 85% of bases higher than Q30 - 2 x 150 bp > 85% of bases higher than Q30 Hoher Daten-Output: Geräte ohne diesen hohen Output sind nur eigeschränkt für High-End Anwendungen geeignet (WES, CGP und WGS für Humangenetik). Hohe Ausgabeleistung: generiert zwischen 165 Gb und 8 Tb pro Lauf. Datenanalyse NoveSeq X: Geräteinterne Hard- und Software zur Datenanalyse - erlaubt die Sekundäranaiyse direkt auf dem Gerät sowie eine (bis zu fünffache) Komprimierung der Daten - reduzierter Speicherbedarf der umfangreichen Sequenzierdaten (ein Lauf des Gerätes mit dem kleinsten Reagent-Kit generiert bereits mehrere Hundert GB an Daten). Systeme mit geringerer Kapazität von der Fa. Illumina werden bereits an der UMR (Hämatologisches Speziallabor, Pathologie, Mikrobiologie) eigesetzt, wodurch die experimentellen und logistischen Abläufe bekannt sind, jedoch für die neu vorgesehene Anwendung nicht etabliert. Zur Etablierung der benötigten Protokolle und Abläufe liegen SOPs der Prozesse zu den „kleineren“ System vor, so dass das neu anzuschaffende System schnell genutzt werden kann. Für die Etablierung äquivalenter Protokolle für alternative Systeme muss für eine diagnostische Anwendung mit ca. 12 Monaten gerechnet werden. Beim Einsatz von Systemen anderer Hersteller müsste somit die Probenvorbereitung (Library Prep) komplett neu etabliert werden. Auch wenn die Probenvorbereitung beim Gerät eines anderen Herstellers ähnlich ist, ist das System für High-End Anwendungen (WES, CGP), welche zur perspektivischen Teilnahme am Modellvorhaben §64 SGB V „genomDE“ zwingend erforderlich sind, nur eingeschränkt nutzbar. Weiterhin besteht für die an der UMR vorhandenen Illumina MiSeq/MiniSeq-Geräte die Möglichkeit, die dort laufenden NGS-Panel direkt auf dem NovaSeq X laufen zu lassen, so dass hier eine Ausfallsicherheit für die vorhandenen Geräte geschaffen wird. Aufgrund der sehr viel höheren Leistungsfähigkeit des NovaSeq X kann die Ausfallsicherheit ohne größere Latenz gewährleistet werden. Weiterhin sind grundlegende bioinformatische Auswertungsstrategien etabliert und können partiell für dieses Gerät direkt übernommen werden. Die Anschaffung des separaten DRAGEN Servers ist zwingend erforderlich, da über den externen DRAGEN Server eine umfassende bioinformatische Analyse und Varianten-Interpretation vorgenommen werden kann. Das Onboard installierte System erlaubt diese Auswertung nicht vollumfänglich. Weiterhin ist die Illumina-Sequenziertechnologie zurzeit Standard bei verschiedenen nationalen-Z-internationalen molekularbiologischen Verbünden, für die eine Kompatibilität und Vergleichbarkeit der generierten Daten unerlässlich ist und wodurch die umfassende Analyse signifikant erleichtert wird. Dies trifft im Besonderen für das Deutsche Netzwerk für Personalisierte Medizin (DNPM) zu, dessen Zertifizierung über “Onkozert“ Voraussetzung für die Zertifizierung der UMR als „Zentrum für Personalisierte Medizin“ ist. Zur Teilnahme am Modellvorhaben §64 SGB V ist diese Zertifizierung elementar.

6.1 Ergebnis, Los-– Kennung : LOT-0001

6.1.2 Informationen über die Gewinner

8. Organisationen

8.1 ORG-0001

Offizielle Bezeichnung : Universitätsmedizin Rostock
Registrierungsnummer : 13-X73130001000-61
Stadt : Rostock
Postleitzahl : 18057
Land, Gliederung (NUTS) : Rostock, Kreisfreie Stadt ( DE803 )
Land : Deutschland
Telefon : 0381-494 5309
Rollen dieser Organisation :
Beschaffer

8.1 ORG-0002

Offizielle Bezeichnung : Vergabekammern beim Ministerium für Wirtschaft, Infrastruktur, Tourismus und Arbeit Mecklenburg-Vorpommern
Stadt : Schwerin
Postleitzahl : 19053
Land, Gliederung (NUTS) : Schwerin, Kreisfreie Stadt ( DE804 )
Land : Deutschland
Rollen dieser Organisation :
Überprüfungsstelle

8.1 ORG-0003

Offizielle Bezeichnung : Illumina GmbH
Stadt : Berlin
Postleitzahl : 10785
Land, Gliederung (NUTS) : Berlin ( DE300 )
Land : Deutschland
Rollen dieser Organisation :
Bieter

8.1 ORG-0000

Offizielle Bezeichnung : Publications Office of the European Union
Registrierungsnummer : PUBL
Stadt : Luxembourg
Postleitzahl : 2417
Land, Gliederung (NUTS) : Luxembourg ( LU000 )
Land : Luxemburg
Telefon : +352 29291
Internetadresse : https://op.europa.eu
Rollen dieser Organisation :
TED eSender

Informationen zur Bekanntmachung

Kennung/Fassung der Bekanntmachung : 988545c3-b1ed-4356-af53-25b0cf158b3d - 01
Formulartyp : Vorankündigung – Direktvergabe
Art der Bekanntmachung : Freiwillige Ex-ante-Transparenzbekanntmachung
Datum der Übermittlung der Bekanntmachung : 17/10/2025 08:48 +00:00
Sprachen, in denen diese Bekanntmachung offiziell verfügbar ist : Deutsch
Veröffentlichungsnummer der Bekanntmachung : 00687484-2025
ABl. S – Nummer der Ausgabe : 201/2025
Datum der Veröffentlichung : 20/10/2025